El servicio normal opera desde las 4:30 horas (madrugada) hasta las 24:00, y tiene la misma tarifa que el resto de las líneas, la cual es de 5 pesos e incluye los transbordos entre líneas sin costo. El servicio al aeropuerto es el que tiene un costo especial, el cual es de 30 pesos. A diferencia de otras líneas, la 4 cuenta con cámaras de vigilancia y espacio para colocar maletas.

En las terminales, las estaciones tienen torniquetes para acceder, en el perímetro A del Centro Histórico, la zona que rodea el Zócalo, son estelas con información sobre el sistema para el usuario y en el resto de la línea, son estaciones más ligeras y sin torniquete. La línea 4 cuenta con un carril exclusivo, cuya operación en ciertos puntos tendrá velocidades máximas de 30 kilómetros por hora; además, se integra a las otras tres líneas de Metrobús y a las líneas del metro 1, 2, 3, 4, 8 y B, además de al Corredor Cero Emisiones de Trolebús y con Ecobici en sus futuras etapas. La línea 4 de Metrobús cuenta con 33 estaciones y 4 terminales.